FLACSO-Uruguay dedica sus mejores esfuerzos a la producción y difusión del conocimiento científico social de carácter fundamentalmente comparativo, y a la docencia de postgrado de excelencia, asegurando la formación de especialistas en Ciencias Sociales. Tiene como propósito central fortalecer los vínculos entre la academia y la formulación de políticas públicas, contribuyendo así al desarrollo integral de la sociedad uruguaya.
FLACSO-Uruguay tiene como misión producir y difundir conocimiento en el área de las ciencias sociales en el Uruguay e influir en la política pública para promover el desarrollo sostenible desde el compromiso con la equidad social y los derechos humanos.
Contribuir al fortalecimiento de las capacidades institucionales para el desarrollo el país con equidad, democracia y gobernabilidad, en un entorno de cooperación internacional.
Para alcanzar estos objetivos, FLACSO-Uruguay se propone desarrollar las siguientes líneas de acción:
• Promover alianzas estratégicas en Uruguay y el extranjero con instituciones de reconocido prestigio y que le permitan a la institución potenciar sus actividades de investigación, docencia y extensión.
• Incentivar en su cuerpo académico y administrativo el respeto mutuo, con miras a su fortalecimiento interno y a su mayor participación en las actividades de la institución y de acuerdo con las normativas que rigen al sistema FLACSO.